"Kommissionen erbjuder EU-länderna en falsk rätt att säga nej som inte kommer att hålla i domstol", säger Franziska Achterberg på Greenpeace i ett uttalande.
Greenpeace befarar nu att de nya reglerna ska bidra till att det blir fler genmodifierade produkter inom EU, trots att förslaget utåt sett verkar handla om motsatsen.
Förslaget ska nu i sedvanlig ordning behandlas av medlemsstaterna och EU-parlamentet.